CPER (2007-2010) – Nord Pas de Calais – Pôle Zooplancton

Le Laboratoire Environnement Ressources de Boulogne-sur-Mer a été choisi pour l’implantation d’un pôle de taxonomie et d’écologie du zooplancton afin de centraliser l’expertise dans ce domaine et de répondre aux besoins liés à une approche écosystémique de la gestion des ressources renouvelables. Ce pôle a été inauguré le 7 mai 2009 en présence du PDG, des représentants de la région Nord – Pas-de-Calais et de la presse. Le pôle comprend 5 postes d’observation du zooplancton par microscopie et 2 postes d’analyses d’image (ZooScan).

Ces activités s’organisent pour le moment autour de deux axes de recherche :

  • la diversité et la structuration spatiale de la communauté zooplanctonique en relation avec l’environnement trophique et écologique sous l’influence des facteurs climatiques, hydrologiques et anthropiques ;
  • le développement, la maîtrise et l’application d’outils permettant l’identification d’organismes planctoniques de façon automatisée et/ou semi-automatisée via l’acquisition et l’analyse d’images.

Le pôle assure, sur la façade Manche, le suivi des communautés zooplanctoniques dans le cadre des actions de surveillance écologique (IGA), de suivi des ressources (campagnes IBTS), ou d’étude sanitaire (Vibrio-Manche).

En 2009, le pôle a poursuivi la sauvegarde numérique de la série historique des échantillons mésozooplanctoniques (> 500 µm) de la Manche provenant de la surveillance écologique de la centrale nucléaire de Gravelines (projet IGA). Seuls les échantillons couvrant la période 1984-2008 (représentant 451 échantillons) ont pu être scannés et reconditionnés pour conservation et archivage. Les échantillons antérieurs se sont révélés trop dégradés pour pouvoir être analysés. Les résultats ont toutefois permis d’obtenir un fichier d’apprentissage spécifique aux espèces zooplanctoniques de la région (ce qui inclus l’ichtyoplancton, à savoir les œufs et les larves de poisson) et d’évaluer les performances en terme de reconnaissance d’un modèle d’identification automatisée des espèces. Ce fichier d’apprentissage est pour l’instant composé d’une trentaine de groupes taxonomiques dont certains nécessitent encore d’être complétés pour être suffisamment représentés et ainsi avoir des taux de bonne reconnaissance satisfaisants (tableau ci-dessous) :

Groupes taxonomiques 

Bonne reconnaissance 

Genre 

Bonne reconnaissance 

Détritus

92.8%

Appendiculaires

94.5%

Acartia 

79%

Chaetognathes

83.2%

88%

Copépodes

97.7%

Centropages 

94%

Mégalopes_Brachyoures

85.1%

Temora 

93%

Zoés_Brachyoures

81.0%

Zoés_Porcellanidés

85.0%

Mysidacés

87.9%

Mesopodopsis 

97%

Cténaires

79.8%

Nauplii de cirripède

89.6%

Cypris de cirripède

81.4%

Annélides

95.2%

Oeufs de poisson

98.7%

Larves de poisson

86.9%

Pourcentage de bonne reconnaissance pour les principaux taxa considérés