C'est en 1954, que sur les quais du port de Boulogne-sur-Mer, il a été décidé la création d'un organisme voué à la recherche scientifique et technique appliquée à la pêche. Trente ans plus tard, l'Institut Scientifique et Technique des Pêches Maritimes fusionne avec le Centre National pour l'Exploration des Océans et devient l'Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer.
 La mise en oeuvre en 1991, d'un bassin d'essais à vocation hydrodynamique dans les bâtiments du Centre National de la Mer, édifié à deux pas du Centre Ifremer, est venu renforcer le potentiel de recherche et développement technologiques.
 

Enfin, en 2009, un pôle de sclérochronologie et une unité dédiée à la taxonomie et l'écologie du zooplancton viennent consolider ses compétences. Ce projet a été soutenu et subventionné par la Communauté Européenne et la région Nord-Pas-de-Calais. + de détails sur l'historique