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La description et la compréhension de la dynamique spatio-temporelle des communautés fait aujourd'hui l'objet d'une attention croissante de la part des scientifiques et des gestionnaires d’écosystèmes. Cette dynamique est en effet déterminante pour le fonctionnement des écosystèmes et par conséquent pour les services rendus à l’Homme. Le suivi spatio-temporel des communautés et la compréhension des mécanismes sous-jacents à leur structuration présente un fort enjeu autant sur le plan environnemental qu’économique. En milieu marin, la structure des communautés de poissons est extrêmement fluctuante, et ce en raison de la variabilité naturelle de l’environnement mais aussi des perturbations anthropiques. Toutefois, la réponse des communautés aux modifications de l’environnement et des pressions humaines n’est que très peu abordée sur le plan fonctionnel. Basé sur les écosystèmes de la Baie de Somme, de la Manche orientale et de la Mer du Nord, les objectifs de cette thèse sont de décrire la dynamique de la structure fonctionnelle des communautés ichtyologiques au cours des 30-40 dernières années, de hiérarchiser les traits bio-écologiques selon leur contribution respective dans la réponse des communautés au changement climatique, et d’identifier les facteurs forçants et leur mécanismes d’effets sur la diversité fonctionnelle des communautés.